Ezt többek között arra hivatkozva kérik, hogy az ügyben az első- és a másodfokú határozatot is a Pest Megyei Kormányhivatal hozta meg - ami legalábbis összeférhetetlen, érvel a magánszemély ügyvédje.
Az előzmények röviden; a beruházó Városliget Zrt. még 2016. szeptember 9-én előzetes vizsgálat lefolytatását kérte a Pest Megyei Kormányhivataltól, mint első fokú környezetvédelmi hatóságtól. A kormányhivatal október 27-i határozata szerint a Közlekedési Múzeum felújításának, valamint mélygarázs létesítésének jelentős környezeti hatása nincs. Fellebbezések nyomán a kormányhivatal módosította határozatát, és felterjesztette másodfokú elbírálásra az Országos Környezetvédelmi és Környezetvédelmi Főfelügyelőséghez. A december 28-án indult másodfokú eljárás azonban „félresiklott", mivel 2017. január 1-től - a központi hivatalok és a minisztériumi háttérintézmények átalakításával - a kormány hasonló ügyekben eljáró környezetvédelmi hatóságként első fokon a Pest Megyei Kormányhivatal Érdi Járási Hivatalát, másodfokon pedig a Pest Megyei Kormányhivatalt jelölte ki. Vagyis jelen ügyben ugyanaz a hatóság döntött első- és másodfokon is.
A január 17-i másodfokú határozatban a kormányhivatal végül megsemmisítette az első fokú határozatot, s már úgy érvelt, hogy a Városliget beépítésére vonatkozó önkormányzati rendelet szerint az adott terület beépítésre nem szánt terület, ezért a környezetvédelmi eljárást nem kell lefolytatni. Nem tudni, a bírósághoz fordulók meg tudják-e akadályozni a beruházás megkezdését a környezetvédelmi vizsgálattal, de arra kérik a bíróságot, függessze fel a két korábbi környezetvédelmi határozatot. A Levegő Munkacsoport beadványa szerint „a környezetvédelmi tárgyú határozat bírósági felfüggesztése nélkül a bírósági felülvizsgálati eljárás lezárásig már olyan készültségi fokba jut a beruházás, amely visszafordíthatatlan károsodást, átalakítást jelent az érintett területen és a környezet állapotában".
Nehezíti helyzetüket, hogy a múzeum korábbi épületét mára teljesen elbontották, és teljesen új épület készül, ráadásul néhány méterrel az eredeti mellett. A kiadott építési engedély 33482 négyzetméteres nettó, azaz hasznosítható területű múzeumi épületre, valamint abban 15 darab gépészeti felvonóberendezés és egy úgynevezett gépészeti mozgólépcső berendezés létesítésére vonatkozik.