Az ismételt választási eljárás kezdetén Merkely Béla, az egyetem Városmajori Szív- és Érgyógyászati Klinikájának igazgatója, aki korábban szintén pályázott a rektori tisztség betöltésére, visszalépett.
A megismételt választásra azért volt szükség, mert az egyetem szenátusának 2015. április 8-i ülésén hozott, szintén Szél Ágostont jelölő határozatával szemben kifogással élt a Semmelweis Egyetem fenntartója, az Emberi Erőforrások Minisztériuma (Emmi). Szél Ágoston a sajtótájékoztatón ismertette: az Emmi álláspontja szerint a korábbi szavazáson a reprezentatív szakszervezetek, illetve a közalkalmazotti tanács képviselőinek száma (2-2) a szenátus létszámához képest meghaladta a nemzeti felsőoktatásról szóló 2011. évi törvényben meghatározott 5-5 százalékos mértéket, mivel a szenátus létszáma a szavazás időpontjában 36 volt.